モード設定 - 「ツール」タブ

「ツール」メニューを編集します。

※バージョン3.0〜バージョン3.7では、プリセットツールとユーザーツールを分けて表示していましたが、バージョン3.8より統合して表示するようになりました。
プリセットツールとユーザーツールの名前(パス)が同じ場合、プリセットツールの方は非表示となり、「プリセットツールを編集した」扱いとなります。