モード設定 - 「ツール」タブ

+ボタンをクリックしてツール項目を追加し、編集します。
モードによっては、いくつかのツールが"アプリ内蔵ツール"としてすでに設定されています。
アプリ内蔵ツールもそのまま編集可能です。
「内蔵ツールの内容に戻す」ボタンで、アプリ内蔵ツールの内容に戻すこともできます。
アプリ内蔵ツールを全く使用せず、全てのツールを完全に独自のツールのみで構成したい場合は、「すべての内蔵ツールを無効にする」チェックボックスをONにしてください。
左のリストに太字で表示される項目は、ユーザーが作成したツール、または、ユーザーが編集したアプリ内蔵ツールです。
「ツールファイルを開いて編集」ボタンを押すと、miのメインウインドウ上で編集することができます。
Finder上でツール構成を編集することも可能です。
「Finderでtoolフォルダを開く」ボタンでツールフォルダを開き、編集後、「Finderで変更したtoolフォルダの変更を反映する」ボタンをクリックしてください。
リストにファイルをドラッグ＆ドロップすることで、追加することも可能です。
「Finder で Application Scripts フォルダを開く」ボタンをクリックすると、Application Scriptsフォルダ（~/Library/Application Scripts/net.mimikaki.mi）に、モード名のフォルダを作成します。このフォルダに格納されたAppleScriptファイルも、ツールメニューに表示されます。
※将来リリースされるかもしれないAppStore版においては、AppStoreのセキュリティ要件により、AppleScriptファイルは、このApplication Scriptsフォルダに格納した場合しか実行できない可能性が高いです。

※バージョン3.0〜バージョン3.7では、内蔵ツールとユーザーツールを分けて表示していましたが、バージョン3.8より統合して表示するようになりました。
内蔵ツールとユーザーツールの名前（パス）が同じ場合、内蔵ツールの方は非表示となり、「内蔵ツールを編集した」扱いとなります。